Spoiler:

- Países e Vilarejos Ocultos
- Clãs e Kekkei Genkais de Konoha
- Hokages e Ninjas Lendários

*Países operam como entidades políticas separadas e são monarquias, governados pelo daimyō, que estão na mesma classificação do Kage das aldeias ocultas.O País do Fogo (火の国, Hi no Kuni) é um dos maiores e mais poderosos países na série e o lar dos principais personagens da série. Seu líder governamental é o Daimyō do Fogo. O País do Fogo foi o primeiro país a adotar uma aldeia ninja, Konohagakure, um costume que em breve outros países vieram a adotar. O País do Fogo é apropriadamente orientado para a Liberação de Fogo, normalmente tendo um clima muito brilhante e quente. Embora não seja o maior país fisicamente, tem a maior aldeia oculta.O País da Água (水の国, Mizu no Kuni) é composto por muitas ilhas, com cada uma tendo suas próprias tradições únicas. O clima do país é tipicamente frio e as ilhas são geralmente cobertos pela névoa. As ilhas em si também têm muitos lagos. Em alguns lugares é muito frio e neva um pouco. A nação é orientada para a Liberação de Água. Seu líder governamental é o Daimyō do País da Água. O País do Som (音の国, Oto no Kuni) é um país vizinho do País do Fogo. É um país relativamente novo na cena política, embora tenha existido durante algum tempo, sob o nome do País dos Campos de Arroz (田の国, Ta no Kuni). O País da Terra (土の国, Tsuchi no Kuni) está localizado a noroeste do País do Fogo. Seu líder governamental é o Daimyō da Terra. O país é maioritariamente composto por áreas rochosas, desoladas. A fronteira do País da Terra é executada ao longo de uma cadeia de montanhas rochosas, bloqueando a comunicação com outros países. O vento sopra do norte e passa sobre estas montanhas, carregando pequenas pedras do País da Terra para os países vizinhos. Este famoso fenômeno natural é chamado de "Chuva de Rocha" (岩雨, Gan'u). O País do Relâmpago (雷の国, Kaminari no Kuni) está localizado em uma península a noroeste do País do Fogo e é um dos Cinco Grandes Países Shinobi. Seu líder governamental é o Daimyō do Relâmpago. No centro do país estão grandes cadeias de montanhas, cujas muitas tempestades são ditas dar o nome ao país. A partir dessas cadeias de montanhas, muitos rios correm para o mar, criando um litoral muito torto que exibe uma impressionante beleza oceânica. Existem muitas fontes termais localizadas dentro do país. O País do Vento (風の国, Kaze no Kuni) é um dos países proeminentes na série. Ele está localizado a sudoeste do País do Fogo e faz fronteira com o País dos Rios e Amegakure. Seu líder governamental é o Daimyō do Vento. O país abrange uma vasta área, mas esse reino é composto em grande parte por desertos. Porque há muito pouca chuva durante todo o ano, os habitantes do país vivem em aldeias construídas sobre um dos muitos oásis do deserto. Apesar das condições ambientais do país serem extremamente duras, ele tem uma grande população. Embora tenham guerreado um com o outro no passado, o País do Vento está em boas relações com o País do Fogo, com um grande acordo comercial acontecendo entre os dois países. O País das Ondas (波の国, Nami no Kuni) é uma nação localizada em uma ilha perto do País do Fogo, e ele não tem uma vila ninja, confiando em buscar de assistência de outras vilas ninja, como Konohagakure. O País do Ferro (鉄の国, Tetsu no Kuni) É um país gelado e coberto de neve. É politicamente incomum que se manteve neutro e nunca esteve envolvido em guerras ninja. Na verdade, os shinobi tem uma regra desde muito tempo que eles não iriam mexer com o país. Apesar disso, é dito que o país tem um poder militar extremamente forte, que é ocupado por samurais, em vez de ninja. O País da Neve (雪の国, Yuki no Kuni) tem uma aldeia oculta chamada de Yukigakure.

*Um clã (一族, Ichizoku), no sentido mais amplo do termo, refere-se a uma família ou grupo de shinobi que formam uma unidade básica de uma aldeia shinobi. A maioria desses clãs eram forças militares mercenárias mesmo antes da Primeira Guerra Mundial Ninja. O clã Senju e o clã Uchiha foram os primeiros clãs conhecidos que concordaram em estabelecer-se e formar uma vila shinobi, facilitada pela criação de acordos com o daimyō da terra que habitam. Muitos clãs seguiriam o exemplo do Senju e o Uchiha, mais tarde estabelecendo os Cinco Grandes Países Ninjas como eles são conhecidos hoje. Ser membro de um clã é geralmente determinado por relações de sangue e genética, que é vital no uso de Kekkei Genkai e técnicas secretas. Estes atributos e habilidades fizeram muitos clãs temidos e conhecidos em muitas aldeias. Enquanto os clãs podem ser compostos de muitas pessoas e famílias extensas, muitos clãs são limitados para uma família nuclear.

Kekkei Genkai (血継限界; Literalmente significa "uma técnica limitada a herança sanguínea" ou "Limite de Linhagem Sanguínea") são habilidades passadas geneticamente em clãs específicos. É possível para um shinobi possuir mais de uma dessas habilidades. Dōjutsu é uma habilidade de kekkei genkai usada pelos olhos, sendo que existem outras usadas através do corpo. Outras kekkei genkai incluem combinar simultaneamente um chakra elementar com outro, criando um tipo novo e único de seus usuários, algo geralmente impossível para shinobi normais.
Kekkei Genkai e suas técnicas relacionadas não podem ser ensinadas ou copiadas pelos demais. Porém, algumas podem ser dadas às pessoas, que é o caso dos dōjutsu ou qualquer kekkei genkai isolada num único órgão, pois podem ser transplantados. O uso desses órgãos requer muito mais chakra do que de alguém que nasceu com a kekkei genkai. Elementos de chakra podem ser passados para pessoas fora de clãs. Apesar de kekkei genkai serem geralmente compartilhadas geneticamente dentro de um clã específico, algumas vezes elas podem ser únicas de uma pessoa, e que nem mesmo parentes conseguem obtê-la. E além disso, outras kekkei genkai manifestam-se em vários indivíduos sem nenhuma relação conhecida.
Os Kekkei genkai mais notáveis de konoha são o Sharingan e o Byakugan.
Byakugan (白眼; Literalmente significa "Olho Branco", que significa "Olho Branco Que Tudo Vê") é o Dōjutsu Kekkei Genkai do Clã Hyūga. Seu poder apareceu pela primeira vez ao lado do Rinnegan, no mais antigo ancestral conhecido dos Hyūga: Kaguya Ōtsutsuki. Tornou-se conhecido como um dos Três Grandes Dōjutsu (三大瞳术, San Dai dōjutsu), juntamente com o Sharingan e o Rinnegan. Esse dōjutsu se manifesta como olhos muito distintos, caracterizados por suas íris brancas ampliadas e feições sem pupilas visíveis. Quando o Byakugan é ativado, as pupilas do usuário se tornam mais distintas, e as veias se elevam perto das têmporas. Parece também que ao contrário dos outros dois grandes dōjutsu, todos os membros do clã possuem e podem usar a kekkei genkai desde o nascimento, em oposição à necessidade de despertar ou mais, não herdá-lo em tudo. A habilidade primária do Byakugan dá ao utilizador um campo de visão perto de 360º, exceto em um ponto cego na parte de trás do pescoço, por cima da primeira vértebra torácica. Após a ativação do dōjutsu, é concedido automático ao usuário uma visão de 50 metros de campo de visão em torno de si, que pode ser estendida por meio de treinamento. O Byakugan também é capaz de ver através de objetos sólidos e cortinas de fumaça, mesmo através da maioria dos obstáculos, uma barreira particularmente forte. Ele também pode diferenciar entre clones não-corporais e pode ver através de técnicas que poderiam esconder um adversário de visão normal. O dōjutsu também tem a habilidade de seguir movimentos em alta velocidade.

O Sharingan (写轮眼; "Olho Copiador Giratório") é um dōjutsu kekkei genkai, que aparece em alguns membros do Clã Uchiha. Enquanto os seus poderes foram observados pela primeira vez em Kaguya Ōtsutsuki, sua verdadeira forma manifestou-se pela primeira vez em Indra, o mais antigo ancestral do clã Uchiha, e mais tarde veio a ser considerado um dos Três Grandes Dōjutsu (三大瞳术, San Daidōjutsu), juntamente com o Byakugan e o Rinnegan. O Sharingan é também chamado de "Olho do Céu" (天眼, Tengan), por causa das muitas habilidades que concede ao usuário. As habilidades do Sharingan consistem de duas partes: o "Olho da Compreensão" (洞察眼, Dōsatsugan) e o "Olho do Hipnotismo" (催眠眼, Saimingan). O primeiro dos poderes do Sharingan é ser capaz de ver o fluxo de chakra. O Sharingan em si dá cor ao chakra, permitindo que o portador de diferencie-os. Eles também são capazes de dizer se uma pessoa está sob um genjutsu, porque o fluxo de chakra da pessoa estaria irregular. A segunda habilidade mais importante do Sharingan concede ao usuário uma incrível clareza de percepção, permitindo-lhes reconhecer facilmente genjutsu e diferentes formas de chakra, embora não na mesma medida como o Byakugan.
O Mangekyō Sharingan (万華鏡写輪眼; Literalmente significa "Olho Copiador Giratório Caleidoscópico"). O Mangekyō Sharingan é despertado através do trauma experimentado da morte da pessoa mais próxima do usuário do Sharingan. Com o usuário normalmente tendo que presenciar ou vivenciar isso em primeira mão, os Uchiha ao longo da história mataram as pessoas mais próximas a eles, a fim de acelerar este processo. Para obter o Mangekyō Sharingan, a pessoa precisa sentir a emoção de perder um amigo ou familiar, porque meramente matá-los ou vê-los morrer não vai ativá-lo.